ソフトウェア
CueMol
CueMol (きゅうもる) は生体高分子の構造を見るためのソフトウェアです. OSのGUIとシームレスでかつ, わかりやすいユーザーインタフェイスを目指して開発を進めています. さらに,論文やプレゼンのための高品位の分子グラフィクスを作成できるという特徴もあります.
LocalColabFold
https://github.com/YoshitakaMo/localcolabfold/
LocalColabFoldは、ColabFoldの機能をユーザーのローカルマシンで利用できるようにするためのインストーラー・スクリプトです。Windows 10以降(Windows Subsystem for Linux 2を使用)、macOS、Linuxなど幅広いOSに対応しています。
AlphaFold3_tools
https://github.com/cddlab/alphafold3_tools/
alphafold3_tools
はAlphaFold3用のツール集です。MSAファイルをAlphaFold3の入力JSONファイルに変換するmsatojson
や、予測されたアラインメントエラー(PAE)を可視化するpaeplot
などのスクリプトが含まれています。